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Steve Vissault M.Sc.
< + > Scientifique, passionné par les données
Bioinformaticien et développeur full-stack, M.Sc. en biologie, avec plus de dix ans d’expérience à l’interface de l’écologie, de la génomique et du génie logiciel. Je conçois des infrastructures de données, des pipelines d’analyse et des applications web qui rendent les données scientifiques accessibles, fiables et réutilisables.
Expériences Professionnelles
Développeur full-stack | Bioinformaticien
Genovalia - Université Laval
Québec, CA
Présent - 2026
Conception et déploiement de solutions orientées données en génomique non humaine
Bioinformaticien
Institut National de la Recherche Scientifique (INRS)
Québec, CA
Présent - 2025
Développement d’applications Shiny | Analyses de métabarcoding | Coordination de la Table sur l’ADNe du Québec | Rédaction de rapports et d’articles scientifiques
Consultant
inSileco Inc.
Sherbrooke, CA
2026 - 2023
Service-conseil en gestion de données | Développement d’applications web sur mesure | Assurance qualité, analyse et traitement de données
Gestionnaire de données
Environnement Canada
Québec, CA
2024
Conception d’une base de données sur des contaminants | Développement d’applications Shiny | Assurance qualité et intégration de données d’analyse en laboratoire
Scientifique de données
Omnimed
Cookshire-Eaton, CA
2023 - 2020
Gestion d’équipe selon les méthodes Agile (Scrum) | Exploration et traitement statistique de données clinico-administratives |
Développement de produits orientés données (ETL / BI)
Professionnel de recherche | Bioinformaticien
Université de Sherbrooke
Sherbrooke, CA
2018 - 2016
Administration d’un laboratoire de recherche | Analyses statistiques et spatiales | Infographie | Développement web | Gestion de serveurs et de bases de données
Bioinformaticien
Direction de la recherche forestière (MFFP) | Ouranos
Québec, CA
2014
(1 mois)
Architecture de base de données spatiales | Ingestion parallèle de 1 To de données sur superordinateur (Calcul Québec) | Séminaire
Assistant de recherche
Université du Québec à Rimouski
Rimouski, CA
2013
(3 mois)
Intégration multisource de données d’inventaires forestiers (É.-U. et Canada) | Analyse démographique des peuplements forestiers d’Amérique du Nord
Diplômes
Doctorat en bioinformatique
Université de Sherbrooke
Sherbrooke, CA
Non complété - 2019
Titre de la thèse - Suivre les changements de biodiversité à l’ère de l’Anthropocène. Automatisation d’approches statistiques reposant sur des données ouvertes afin de modéliser les changements de biodiversité.
Maîtrise en biologie
Université du Québec à Rimouski
Rimouski, CA
2016 - 2013
Approche par modélisation statistique et informatique
Mention d’excellence pour le mémoire Biogéographie et dynamique de la forêt tempérée nordique dans un contexte de changements climatiques
Baccalauréat en biologie
Université du Québec à Rimouski
Rimouski, CA
2013 - 2010
Concentration - Gestion de la faune et de ses habitats
DEC en techniques de bioécologie
Cégep de La Pocatière
La Pocatière, CA
2010 - 2007
Ateliers
Groupe de réflexion sur l’utilisation de l’eDNA au Québec
Organisateur
Québec et Montréal, CA
2026
Groupe de travail financé par Génome Québec et Génome Canada
Visualisation des données scientifiques
Organisateur
Mt. Saint-Hilaire, CA
2016
Atelier de 2 jours financé par le Centre des Sciences de la Biodiversité du Québec
Certification
Introduction au Design Thinking
Centre de formation continue - Cégep de Sherbrooke
Virtuelle
2023
Déploiement et utilisation responsable de l’intelligence artificielle
Programme d’éducation de l’AMII - Attestation
Virtuelle
2022
Calcul de haute performance (HPC)
École de printemps de Calcul Québec
Orford, CA
2014
Enseignements
Formation à la manipulation d’objets spatiaux avec R
Congrès EcotoQ
Québec, CA
Juin, 2026
Formateur et conception du matériel pédagogique
Formation au métabarcoding avec BARQUE
INRS
Québec, CA
Octobre, 2025
Formateur et conception du matériel pédagogique
How to make your scientific code accessible and reproducible using Git and Github?
Environnement Canada
Québec, CA
Avril, 2025
Formateur et conception du matériel pédagogique
Géostatistiques - Modèles spatio-temporels
GSFE01 - PR Stats
Winnipeg, CA
2019
Formateur et aide au montage du matériel pédagogique
Méthodes computationnelles en écologie
BIO500 - Université de Sherbrooke
Sherbrooke, CA
2019 - 2017
Assistant et aide au montage du matériel pédagogique
Introduction à la programmation scientifique
BIO109 - Université de Sherbrooke
Sherbrooke, CA
2017
Assistant et aide au montage du matériel pédagogique
Biostatistiques
BIO10091 - Université du Québec à Rimouski
Rimouski
2014
Auxiliaire d’enseignement
Publications scientifiques
Evaluation of satellite-based sea surface salinity derived from two distinct spectral domains over the coastal waters of the St. Lawrence Estuary and Gulf
Laliberté J., Guénard G., Dumas J., Galbraith P.S., Hall S., Trossman D.S., Vissault S.
N/A
14
Frontiers in Marine Science, 12 (2025) - doi:10.3389/fmars.2025.1672298
Mangal.jl and EcologicalNetworks.jl: Two complementary packages for analyzing ecological networks in Julia
Banville F., Vissault S., Poisot T.
N/A
13
Journal of Open Source Software, 6(61): 2721 (2021) - doi:10.21105/joss.02721
Global knowledge gaps in species interaction networks data
Poisot T., Bergeron G., Cazelles K., Dallas T., Gravel D., MacDonald A.A.M., Mercier B., Violet C., Vissault S.
N/A
12
Journal of Biogeography, 48(7): 1552-1563 (2021) - doi:10.1111/jbi.14127
Slow demography and limited dispersal constrain the expansion of north-eastern temperate forests under climate change
Vissault S., Talluto L., Boulangeat I., Gravel D.
N/A
11
Journal of Biogeography, 47(12): 2645-2656 (2020) - doi:10.1111/jbi.13978
Moderate disturbances accelerate forest transition dynamics under climate change in the temperate-boreal ecotone of eastern North America
Brice M.-H., Vissault S., Vieira W., Gravel D., Legendre P., Fortin M.-J.
N/A
10
Global Change Biology, 26(8): 4418-4435 (2020) - doi:10.1111/gcb.15143
Characterizing exposure to and sharing knowledge of drivers of environmental change in the St. Lawrence system in Canada
Beauchesne D., Daigle R., Vissault S., Gravel D., et al., Archambault P.
N/A
9
Frontiers in Marine Science, 7: 383 (2020) - doi:10.3389/fmars.2020.00383
Four decades of plant community change along a continental gradient of warming
Becker-Scarpitta A., Vissault S., Vellend M.
N/A
8
Global Change Biology, 25(5): 1629-1641 (2019) - doi:10.1111/gcb.14568
Mangal: An open infrastructure for ecological interactions
Vissault S., Gravel D., Poisot T.
N/A
7
Biodiversity Information Science and Standards, 3: e37037 (2019) - doi:10.3897/biss.3.37037
Our house is burning: Discrepancy in climate change vs. biodiversity coverage in the media as compared to scientific literature
Legagneux P., Casajus N., Cazelles K., et al., Vissault S., et al., Gravel D.
N/A
6
Frontiers in Ecology and Evolution, 5: 175 (2018) - doi:10.3389/fevo.2017.00175
Extinction debt and colonization credit delay range shifts of eastern North American trees
Talluto L., Boulangeat I., Vissault S., Thuiller W., Gravel D.
N/A
5
Nature Ecology & Evolution, 1: 0182 (2017) - doi:10.1038/s41559-017-0182
Changes in phytoplankton bloom phenology over the North Water (NOW) polynya: a response to changing environmental conditions
Marchese C., Albouy C., Tremblay J.-É., Dumont D., D’Ortenzio F., Vissault S., Bélanger S.
N/A
4
Polar Biology, 40(9): 1721-1737 (2017) - doi:10.1007/s00300-017-2095-2
Food-web structure of willow-galling sawflies and their natural enemies across Europe
Kopelke J.-P., Nyman T., Cazelles K., Gravel D., Vissault S., Roslin T.
N/A
3
Ecology, 98(6): 1730 (2017) - doi:10.1002/ecy.1832
mangal - making sense of biotic interaction data
Poisot T., Gravel D., Vissault S.
N/A
2
Biodiversity Information Science and Standards, 1: e19993 (2017) - doi:10.3897/tdwgproceedings.1.19993
Does probability of occurrence relate to population dynamics?
Thuiller W., Münkemüller T., Schiffers K.H., et al., Vissault S., et al., Schurr F.M.
N/A
1
Ecography, 37(12): 1155-1166 (2014) - doi:10.1111/ecog.00836
Logiciels
rmangal: ‘Mangal’ Client (R package)
Vissault S., Cazelles K., Bergeron G., Mercier B., Violet C., Gravel D., Poisot T.
N/A
2019
STModel-Simulation: State Transition Model
Vissault S., Talluto L., Desjardins-Proulx P.
N/A
2015
Zenodo - doi:10.5281/zenodo.28215
Comment visualiser les changements de biodiversité?
Organisateur
N/A
2019 - 2017
Groupe de travail multidisciplinaire financé par le Centre des Sciences de la Biodiversité du Québec